Nel corso del Seicento la Sardegna viene colpita ripetutamente da epidemie di peste. Quella del 1652 ha effetti disastrosi e minaccia la città di Cagliari che si affida alla protezione di Sant’Efisio impegnandosi a celebrare annualmente in suo onore una festa più solenne. Tuttavia il terribile morbo colpisce la città e nel 1656 il Consiglio Generale di Cagliari affida la salvezza della città e dell’isola a Sant’Efisio, deliberando un’ulteriore offerta di cento scudi alla Chiesa nel quartiere di Stampace.